本來雜賀眾響本願寺投降後親近織田,但本能寺之變後「雜賀孫市」鈴木重秀被主戰既土橋派反擊,離開雜賀眾並改投羽柴秀吉,曾經參加過小牧長久手之戰。
1585年4月,羽柴秀吉與德川家康、織田信雄議和後,諗起雜賀眾曾背刺大坂城,決定完全殲滅呢班滋事份子,率領十萬大軍進攻雜賀。雜賀眾、根來眾聯手響和泉國建立「北方絕對防衛線」,羽柴秀吉於是兵分三路進攻。
雜賀眾「北方絕對防衛線」
東邊戰線以羽柴秀次、筒井定次、黑田長政、長谷川秀一為首,進攻根來眾既千石崛城,城內千五根來眾及四千五平民以強大既火力死守,側擊既部隊被鐵砲雨沐浴。筒井軍乘夜迂迴到後門,對城內放火矢,因城內藏有大量硝石火藥而爆炸,陷入火海既根來眾陣腳大亂,羽柴軍乘勢攻城,屠殺城內所有百姓及動物。
中央戰線以細川忠興、大谷吉繼、蒲生氏鄉、池田輝政主,攻打積善寺,細川先鋒軍率先抵擋鐵砲攻擊,傷亡慘重;蒲生部將松井康之趁機殺入,擊破敵兵並圍城,隔日積善寺投降。
西邊戰線以高山右近、中川秀政為主,攻打沼城,中川秀政身先士卒,攻破二丸後沼城請降,羽柴秀長准許,三線攻破後整個「北部絕對防衛線」各城紛被攻破,徹底崩潰。
雜賀眾各據點圖
3月23日,羽柴秀吉轉進岸和田城,殘兵不多既根來寺隔日被燒毀,竹中重門《豐鑑》記載寺院係秀吉下令燒毀,另有記載指根來寺自己燒寺,同時附近既粉河寺亦被燒毀,逃亡既根來眾首領被增田長盛截殺。
北線被破,雜賀眾開始發生內亂,國人白樫氏策反雜賀岡眾,攻打湊眾,湊眾坐船到四國投靠長宗我部家,羽柴軍到雜賀火燒村莊,雜賀眾殘兵死守太田城。
3月25日秀吉包圍太田城,勸降失敗後大舉進攻,初時強攻失利後,下令修築堤壩,轉水攻。另一邊仙石秀久、中村一氏、小西行長由水路進入紀州南部,攻破反抗勢力 - 湯河直春、畠山政尚既居城。28日仙石秀久、杉若無心攻陷泊城,再兵分兩路進攻,不過因為南紀州軍既反擊而陷入對峙。
太田城堤壩圖
4月5日堤壩完成,加上時逢暴雨,太田城被河水淹沒大片地方,秀吉出動十三艘安宅船包圍,點知太田城派一班游泳健將潛入,從下擊沉,呢班人響今日既話,可以挑戰「徒手游出公海」。另外圍城期間宇喜多秀家位置崩堤,淹死百幾人,之後趕緊修復。
而南紀州方面,奧熊野既堀內氏善響4月13日投降,而口熊野既安宅家亦歸順秀吉,南紀州平定。另外秀吉亦響4月16日與高野山既僧人達成共識,解除山上武裝。
太田城方面,4月21日秀吉再派安宅船炮轟城池,一度佔據大半座城,但被雜賀眾死戰擊退。被圍城斷糧一個月,首領太田左近等53位雜賀首領終於響4月22日提出切腹換百姓平安,太田城開城投降。秀吉戰後沒收武器,破壞神社及清剿餘黨,不過至少歸還農具,呢次沒收武器被認為係秀吉日後「刀狩令」、「全國兵農分離」既開端。此戰後,現任「雜賀孫市」鈴木重秀下落不明,此後再冇記載。
戰後秀吉安排藤堂高虎修築和歌山城,以桑山重晴擔任城主,藤堂高虎、杉若無心、堀內氏善協助,隨後羽柴秀長開始「檢地」明定紀州一帶既石高,紀州徹底平定。
現存既和歌山城