埃及擔心,一旦開閘放人,哈馬斯等巴勒斯坦激進分子會混雜其間,破壞西奈半島的穩定。2011年穆巴拉克被推翻後,主要由貝都因人組成的伊斯蘭恐怖組織經常在西奈半島襲擊政府軍,雖遭埃及過渡政府清剿,但收效甚微。次年莫爾西上台後試圖對西奈半島實施和解政策未果。2013年,莫爾西遭廢黜,西奈半島暴亂事件激增。
2014年當地伊斯蘭激進組織「耶路撒冷支持者」公開聲明效忠伊斯蘭國,並更名為「伊斯蘭國」西奈分支。塞西當政後承諾堅決打擊恐怖分子,剷除恐怖主義的根源。2018年以來,埃及安全部隊在全國範圍內展開多次反恐行動,已打死上千名恐怖分子,但伊斯蘭極端勢力還在不斷反撲。今年9月18日,又發生了7名埃及軍人在西奈半島西北部被埃及武裝分子炸彈炸死的慘劇。可以說,過去十年,遠離開羅的西奈半島一直深受伊斯蘭恐怖主義困擾。
埃及政府和哈馬斯關係緊張,指責哈馬斯在背後支持西奈半島的極端組織。事實上,「伊斯蘭抵抗運動(哈馬斯)」是上世紀80年代末由埃及穆斯林兄弟會巴勒斯坦分部創建的一個專門襲擊猶太人的伊斯蘭聖戰組織,其宗旨是解放以色列占領下的巴勒斯坦,在包含今日以色列、約旦河西岸和加沙地帶的這一地區建立一個伊斯蘭國家。2007年6月,哈馬斯奪取了加沙地帶控制權,「巴勒斯坦民族解放運動(法塔赫)」退守約旦河西岸。
自此,埃及政府不僅自己封鎖了邊界,而且也支持以色列對加沙地帶的封鎖。到2018年,埃及拆除了拉法數千座房屋,摧毀了埃及和加沙之間的地下隧道網絡,甚至用水灌之,建立了一個近一英里寬的緩衝區,堵絕恐怖分子來回走動和運送武器。2020年,埃及又建造了一堵掘地16英尺、高20英尺的鋼筋混凝土牆, 嚴防加沙戰火不會殃及埃及。
穆斯林兄弟會是埃及總統塞西的政治死敵。埃及領導人擔心哈馬斯可能會加劇尼羅河穀的不穩定,一直在尋求控制哈馬斯,埃及情報機構更是在加沙設點密切監視哈馬斯的活動。從埃及的角度看,可以說,以色列相當於替自己打了一場追剿哈馬斯的戰爭,有助於進一步削弱穆兄會的勢力。早在2014年以哈衝突期間,埃及一度希望以色列摧毀哈馬斯,但以色列擔心加沙地帶出現權力真空引發混亂,沒有這樣做。
鑒於哈馬斯與西奈半島伊斯蘭激進組織關係密切,埃及完全有理由擔心大批巴勒斯坦人入境會引狼入室,給境內外極端組織勾連提供機會,使西奈半島這個問題嚴重的地區出現新的安全問題。當然,埃及同樣擔心,拉法口岸放開人流將使西奈半島成為哈馬斯「襲擊以色列的基地」,在這種情況下,以色列當然「有權自衛……襲擊埃及領土」,從而引發埃以大戰,阿以之間持續時間最長的和平協議恐毀於一旦。毫無疑問,這是埃及不願意看到的。