沈祖堯覺得，能出任新加坡南洋理工大學醫學院院長是一個偶然的機會。當時醫學院正尋找一名醫學院院長，遴選委員會主席是劍橋大學榮休校長Sir Leszek Borysiewicz。Sir Leszek Borysiewicz與沈祖堯相熟，邀請對方加入醫學院的遴選委員會。遴選委員會有10多人，但花了9個月仍未覓得合適的人選。就算有人獲聘，對方也不考慮。遴選過程整整一年，醫學院決定邀請沈祖堯加入。
沈祖堯在遴選過程中，嘗試了解新加坡南洋理工大學醫學院，覺得院校很特別。新加坡政府覺得，只有新加坡國立大學才有醫學院並不足夠，而且想培訓多些家庭醫生，以及在公共衛生花點工夫，於是新加坡南洋理工大學與英國倫敦帝國學院合辦醫學院。
「我認為年輕的醫學院有很多新嘗試的機會。」雖然新加坡南洋理工大學醫學院只有十年的歷史，但沈祖堯覺得發展空間很大。
新加坡南洋理工大學着重工程學科，大學在工程學上的世界排名是五強之內。人工智能更是大學的強項。沈祖堯預計人工智能和醫學會緊密相扣。他認為現時兩者之間存在隔膜，是人們對人工智能不信任。「電腦分析數據，指病人有病，但他未必相信。」沈祖堯希望能消除人工智能和醫學之間的隔膜。
沈祖堯覺得人工智能是很大的突破，將會影響整個醫療界的運作，也影響學生的訓練。「將來的醫生如果不懂大數據，不懂與機器人合作，其實很糟糕。」
沈祖堯認為，自己曾經擔任中大校長，是獲新加坡南洋理工大學醫學院邀請的原因。沈祖堯對各個學科都有認識。新加坡南洋理工大學着重跨領域、跨學科的合作。因此，沈祖堯不但擔任醫學院院長，也出任大學副校長，統籌生命科學的研究，他坦言自己喜歡新嘗試。
沈祖堯透露，有很多院校也邀請他出任校長，他都婉拒了。「我希望我的事業最後一章，都是與醫學有關，就很圓滿。」
香港與新加坡文化相近，兩地相距不遠，吸引沈祖堯到新加坡發展。他覺得新加坡南洋理工大學與香港中文大學相似，同樣着重中國文化。新加坡南洋理工大學的前身為南洋大學，由一群華僑興建，初期以中文教學。前總理李光耀推動英語為新加坡主要語言，南洋大學曾一度停辦，直至70年代復辦，並發展成南洋理工大學，更享負盛名。
沈祖堯認識南洋理工大學首任校長Bertil Andersson，是瑞典人。兩人曾一起去瑞典開會。沈祖堯欣賞整間大學充滿生氣。他未履新就要參加很多會議，覺得院校的未來發展很有前瞻性。
沈祖堯坦言，在香港中文大學工作了30多年，已經滿足。他希望香港中文大學與南洋理工大學加強交流。「我希望兩間大學緊密合作，而且兩間大學那麼相似。」
