不過，在《漫威蜘蛛人 重製版》PC版上架後沒多久，卻很快就發生了一起因模組更換而引發的爭議事件。這是由名叫Mike Hawk (har har) 的模組創作者，鎖上傳的更換旗幟模組「Non-Newtonian New York」，玩家可以藉由該MOD，來更換原出現在遊戲中的同志彩虹旗。
但由於該模組頁面上的敘述中，以諷刺的方式來表達《漫威蜘蛛人 重製版》中的彩虹旗太多，再加上底下留言也出現了恐同言論，導致該模組很快地成為了社群網路上的爭議，同時也迎來不少的批評與撻伐，指控該MOD創作者涉嫌歧視言論。
也在此起爭議越演越烈之下，這組「Non-Newtonian New York」模組便很快地從MOD網站Nexus Mods中下架，同時MOD創作者Mike Hawk (har har)的帳號也遭到Nexus Mods官方永久停權的處分。
https://www.toy-people.com/?p=73912
